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ahpcc_slurmjob_watcher

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ahpcc_slurmjob_watcher [2019/11/04 02:03]
trr007
ahpcc_slurmjob_watcher [2019/11/04 23:17]
trr007
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 </​code>​ </​code>​
  
-Here are some real-world examples of how to use this script (assuming the above-mentioned alias is set): +Here are some real-world examples of how to use this script (assuming the above-mentioned alias is set), including some example output
  
 Display the above help page only:  Display the above help page only: 
Line 111: Line 111:
   sjob 00   sjob 00
   sjob all   sjob all
 +  ​
 +  =============================================================================================================
 +   # ​      ​JOBID ​  ​PARTITION ​ NODES  CPUS    HEAD_NODE ​   TIME_LIMIT ​           ELAP_TIME ​   JOB_NAME ​ WORK_DIR
 +  -------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 +   ​1 ​       6310       ​condo ​     1    16        c1310      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory1/​
 +   ​2 ​       6311       ​condo ​     1    16        c1310      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory2/​
 +   ​3 ​       6312       ​condo ​     1    16        c1311      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory3/​
 +   ​4 ​       6313       ​condo ​     1    16        c1311      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory4/​
 +   ​5 ​       6314       ​condo ​     1    16        c1312      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory5/​
 +   ​6 ​       6315       ​condo ​     1    16        c1312      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory6/​
 +  =============================================================================================================
 +   # ​      ​JOBID ​  ​PARTITION ​ NODES  CPUS   ​SCHEDNODES ​   TIME_LIMIT ​      ​EST_START_TIME ​   JOB_NAME ​ WORK_DIR
 +  -------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 +   ​1 ​       6323       ​condo ​     1    16       ​(null) ​     12:​00:​00 ​                 N/A     ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory7/​
 +   ​2 ​       6324       ​condo ​     1    16       ​(null) ​     12:​00:​00 ​                 N/A     ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory8/​
 +   ​3 ​       6325       ​condo ​     1    16       ​(null) ​     12:​00:​00 ​                 N/A     ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory9/​
 +  =============================================================================================================
  
-Display only the job with $SLURM_JOBID=1667: ​ 
-  sjob -j 1667 
  
-Display information for all running jobs and only the first 10 queued jobs:  + 
-  sjob 10+Display only the job with $SLURM_JOBID=6314:​  
 +  sjob -j 6314 
 + 
 +Display information for all running jobs and only the first queued jobs:  
 +  sjob 
 +  ============================================================================================================= 
 +   # ​      ​JOBID ​  ​PARTITION ​ NODES  CPUS    HEAD_NODE ​   TIME_LIMIT ​           ELAP_TIME ​   JOB_NAME ​ WORK_DIR 
 +  ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 
 +   ​1 ​       6310       ​condo ​     1    16        c1310      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory1/​ 
 +   ​2 ​       6311       ​condo ​     1    16        c1310      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory2/​ 
 +   ​3 ​       6312       ​condo ​     1    16        c1311      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory3/​ 
 +   ​4 ​       6313       ​condo ​     1    16        c1311      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory4/​ 
 +   ​5 ​       6314       ​condo ​     1    16        c1312      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory5/​ 
 +   ​6 ​       6315       ​condo ​     1    16        c1312      12:​00:​00 ​                ​0:​06 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory6/​ 
 +  ============================================================================================================= 
 +   # ​      ​JOBID ​  ​PARTITION ​ NODES  CPUS   ​SCHEDNODES ​   TIME_LIMIT ​      ​EST_START_TIME ​   JOB_NAME ​ WORK_DIR 
 +  ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 
 +   ​1 ​       6323       ​condo ​     1    16       ​(null) ​     12:​00:​00 ​                 N/A     ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory7/​ 
 +   ​2 ​       6324       ​condo ​     1    16       ​(null) ​     12:​00:​00 ​                 N/A     ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory8/​ 
 +  ============================================================================================================= 
 +   
  
 Display extra, "​verbose"​ information for all running jobs:  Display extra, "​verbose"​ information for all running jobs: 
   sjob -v   sjob -v
  
-Display extra, "​verbose"​ information only for job with $SLURM_JOBID=1667:  +Display extra, "​verbose"​ information only for job with $SLURM_JOBID=6314:  
-  sjob -j 1667 -v+  sjob -v -j 6314 
 +  ======================================================================================================================================== 
 +   # ​      ​JOBID ​  ​PARTITION ​ NODES  CPUS    NODE_LIST ​ CPU_1m ​ CPU_15m ​   TIME_LIMIT ​           ELAP_TIME ​   JOB_NAME ​ WORK_DIR / COMMENT 
 +  ​---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 
 +   ​5 ​       6314       ​condo ​     1    16        c1312   ​14.06 ​    ​1.22 ​     12:​00:​00 ​                ​0:​36 ​    ​GROMACS ​ /​my/​example/​job/​directory5/​ 
 +                                                                                                                                  20400       ​10.20000 
 +   
 +  ======================================================================================================================================== 
ahpcc_slurmjob_watcher.txt · Last modified: 2019/11/04 23:24 by trr007